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許多企業和財務部門認為，只要本月納稅申報順利完成，就沒有別的了。但實際上，這個觀點是大錯特錯的。納稅申報后，企業需要認真自查。如果自查不到位，稅務機關會來找你。關于稅務稽查，企業必須認真看待和落實以下七個關鍵問題！
1、增值稅零申報問題
零申報恐怕是一些投機企業常用的手段了。特別是一些不夠負責任的代賬公司可能是為了省事也常常會用零申報。但長期零申報風險很大。如果零申報持續6個月，稅務機關將對企業進行分析調查，確認企業是否隱藏收入。
2、稅負率異常問題
各行業的平均增值稅和所得稅負擔水平都記錄在當地的稅收制度中。如果平均稅負波動不大，可能不會引起任何關注。一旦超過20%，稅務機關將進行稅務評估，調查原因。異常稅務異常一直是稅務稽查的重點，應引起重視。
3、進項發票對比問題
其實在“金三”系統上線之前，稅務機關就相當重視增值稅進項和銷項的大規模審核了，主要審核對象是，發票內容的一致性和稅率的準確性。這使很多想鉆空子的商貿企業都焦頭爛額了。
4、稅收優惠企業認定問題
對于那些享受稅收優惠政策的企業，一直都是稅務機關專門清查的重點。畢竟可以得到實實在在的實惠，想鉆空子的人自然就會很多。
5、農產品抵扣問題
免稅的農產品一直都是虛開發票的主要源頭之一，因為像農業合作社這類農業生產者可以享受自產自銷的的農產品免稅的政策，而這些免稅的農產品給下游采購開具的銷售發票是可以抵扣進項稅的，這就使一些企業動了歪腦筋，打起了虛開發票的主要。因此國家現在對虛開農產品發票的行為查的很嚴，一旦發現，必將嚴懲。
6、發票用量有出入問題
稅務機關每個月都會對企業所使用的發票數量、種類、領用存情況以及購領發票數量和實際使用數量之間的出入進行嚴格審核。而發票的增量和增版都是十分困難的，一旦企業提出增量增版，稅務機關一定會實地考察企業情況，現階段稅務機關正在大力嚴打虛開發票行為。
7、重點稅源企業問題
重點稅源企業也一直是稅務機關關照的對象。怎么說也是納稅大戶，這些企業一家的納稅額比很多中小企業加一起還多，如果這類企業出現了偷稅漏稅的問題，那稅收損失該有多大呀，因此要做好隨時迎來稅務機關檢查的準備。
